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地球生物学助理教授 & Environmental Science

国家溶洞与喀斯特研究所学术主任

 

我是一名地球微生物学家和生物地球化学家，专门研究微生物硫循环 以及洞穴系统中微生物与矿物的相互作用. 除了我对洞穴的研究 和喀斯特，我在地球微生物学领域有不同的研究兴趣，包括 矿山废弃物、海洋沉积物和湿地生态系统中的微生物过程.

在NMT和NCKRI任职之前，我曾担任项目协调员 bioremediation-focused MnDRIVE Environment 他是明尼苏达大学的一名研究助理 明尼苏达生物技术研究所. I am also graduate faculty 他在明尼苏达大学地球与环境科学系工作.

下图:最近的实验室组照片(2022年秋季和2024年春季). 

从左到右，2022年秋季: D. Jones, Zoë Havlena, Kathryn Hobart, Calyssa Huff, Katherine Krizek, Mackenzie Best， 阿比盖尔·布朗，凯特琳·格林. 从左到右，2024年春季: 凯特琳·格林、卡丽莎·赫夫、麦肯齐·贝斯特、Zoë哈夫莱娜、约瑟夫·霍伯格、吉米·斯威夫特、 Nathaniel Jobe(基夫特实验室硕士学生)，Cassandra Skaar, Anika Baloun, Laura Rodriguez.

 

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丹的研究网站(正在更新中)

NMT的洞穴和喀斯特研究

国家溶洞与喀斯特研究所

科学传播课活动(sciworthy.com)

 

Courses: 

Geomicrobiology (Fall 2022 syllabus)

Earth History (Spring 2024 syllabus)

教师科学硕士地球史课程(MST) (Spring 2023 syllabus)

Special Topics in Cave & Karst Processes (Spring 2020 syllabus)

Metagenomic Analysis (Spring 2023 syllabus)

洞穴地质学概论(Fall 2023 syllabus)

环境微生物学(Spring 2024 syllabus)

 

选择最近的出版物:

Havlena ZE^*， Hose LD, DuChene HR, Baker GM, Powell D, Labrado AL, Brunner B， Jones DS (in review at Geobiology). 雷曼岩洞次生矿床成因及现代微生物生态学 美国内华达州大盆地国家公园. (预印本可在bioRxiv， http://doi.org/10.1101/2023.08.15.553329)

Hobart KK^*, Greensky Z^**, Hernandez K^**， Feinberg JM, Bailey JV， Jones DS (2023)富硫化物超镁铁质风化露头的微生物群落 入侵及其对矿山废物管理的影响. Environ Microbiol, 25(12), 3512–3526. http://doi.org/10.1111/1462-2920.16489

Jones DS， schaperdies I, Northup DE, Gómez-Cruz R, Macalady JL(2023)，收敛社区 整体分离的酸性洞穴生物膜之间的组装. Appl Environ Microbiol v.89, e01575-22. http://doi.org/10.1128/aem.01575-22

Jones DS, Northup DE (2021). 用微生物装饰洞穴:洞穴的地球微生物学. Elements 17(2). http://doi.org/10.2138/gselements.17.2.107

Hose LD, Duchene HR, Jones DS, Baker G, Havlena ZE^*， Sweetkind D, Powell JD(2021)大盆地深部岩溶，Florsheim J .; Koeberl C, Riggs N，和McKay MP，编.会议指南:地质学会 美国野外指南61页. 1–38. http://doi.org/10.1130/2020.0061(05)

Havlena ZE^*， Kieft T, Veni G, Horrocks R， Jones DS (2021). 光照对光合生物膜发育和多样性的影响 新墨西哥州卡尔斯巴德岩洞的社区. Appl Environ Microbiol 87: e02695-20. http://doi.org/10.1128/AEM.02695-20

Jones DS， Johnson NW, Mitchell CP, Walker GM^**，贝利JV，牧师J, Swain EB (2020). Diverse communities of hgcAB⁺微生物甲基化汞在淡水沉积物受到实验 sulfate loading. Environ Sci Tech, 54: 14265. http://doi.org/10.1021/acs.est.0c02513

Jones DS, Walker GM, Johnson NJ, Mitchell CPJ, Coleman Wasik JK, Bailey JV (2019). 硫酸盐影响下新型汞甲基化微生物的分子证据 lakes. ISME J 13: 1659-1675 (http://doi.org/10.1038/s41396-019-0376-1)

Jones DS, Lapakko KA, Wenz ZJ, Olson MC, Roepke EW, Sadowsky MJ, Novak PJ, Bailey JV (2017). 新的微生物组合主宰了风化的含硫化物的铜镍岩石 美国明尼苏达州德卢斯综合矿床. Appl Environ Microbiol 83:e00909-17 (http://doi.org/10.1128/AEM.00909-17)

Galdenzi S and Jones DS， (2017). 弗拉萨西洞穴:一个“经典的”活跃的地下构造 cave. Klimchouk A, Palmer A, Waele JD, auuler A, Audra P(主编)，下第三纪岩溶区 and Caves of the World. Springer. (http://doi.org/10.1007/978-3-319-53348-3_8)

Jones DS, schaperdoes I, Macalady JL (2016). 硫氧化的生物地理学 Acidithiobacillus 极酸性洞穴生物膜中的种群. ISME J 10: 2879 (http://doi.org/10.1038/ismej.2016.74)

Jones DS, Flood BE, Bailey JV (2016). 多磷酸盐的超转录组学研究 海洋沉积物中的代谢; ISME J 10: 1015 (DOI: http://doi.org/10.1038/ismej.2015.169)

Jones DS and Macalady, JL (2016). 流鼻涕的和粘稠的:地下的能量 life in caves. 环境微生物学进展:它们的世界:多样性 微生物环境，编辑. by C.J. 赫斯特，施普林格DE，海德堡，德国，p. 203-224 (http://doi.org/10.1007/978-3-319-28071-4_5)

Jones DS, Polerecky L, Dempsey BA, Galdenzi S, Macalady JL (2015). Fate of sulfide 在Frasassi洞穴系统和对硫酸洞穴形成的启示， Chem Geol 410: 21 (http://doi.org/10.1016/j.chemgeo.2015.06.002)

Jones DS, Kohl K, Grettenberger C, Larson LL, Burgos WD, Macalady JL (2015). Geochemical 煤矿排放物中铁氧化性嗜酸菌生态位的研究 Appl Environ Microbiol 81: 1242 (http://doi.org/10.1128/AEM.02919-14)

Jones DS, Flood BE, Bailey JV (2015). 小品的超转录组学分析 Thiomargarita-like bacteria (Candidatus Thiopilula spp.)从巴巴多斯吸积棱镜的深海冷渗漏中， Appl Environ Microbiol 81: 3142 (http://doi.org/10.1128/AEM.00039-15)

Zerkle AL, Jones DS, Farquhar J, Macalady JL (2015). 硫同位素值 意大利中部硫化物的Frasassi洞穴系统:一个趋化岩石营养的案例研究 S-based ecosystem, Geochim Cosmochim Acta 173: 373 (http://doi.org/10.1016/j.gca.2015.10.028)